Prof. Dr. Bernhard Brüne war/ist im Vorstand von Stiftungen und wissenschaftlichen Beiräten verschiedener Forschungseinrichtungen. Seine Forschungsarbeiten werden kontinuierlich durch die DFG, andere Drittmittelgeber, die Industrie sowie diverse Stipendien unterstützt. Er hat zahlreiche wissenschaftliche Arbeiten veröffentlicht, Patente erworben und ist Mitglied in nationalen/internationalen Fachgesellschaften.
Als Vizepräsident verfolgt er das Ziel, optimale Bedingungen für Nachwuchs und Forschung zu etablieren und die Goethe-Universität unter den besten Universitäten in Deutschland zu positionieren.